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普通PCR引物與qPCR引物的對(duì)比

更新時(shí)間:2023-06-30      瀏覽次數(shù):1041

普通PCR和熒光定量PCR的檢測(cè)方式具有較大的差別。熒光定量PCR實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)與DNA結(jié)合的熒光染料激發(fā)的熒光,普通PCR通過檢測(cè)插入DNA中核酸染料的量來測(cè)定PCR最終產(chǎn)物量。熒光定量PCR可以通過擴(kuò)增曲線進(jìn)行精確定量,普通PCR則是通過電泳的方式進(jìn)行定性分析。那么在普通PCR和熒光定量PCR的引物設(shè)計(jì)方面,有什么相同點(diǎn)和不同點(diǎn)呢?今天小編就給大家匯總一下。

相同處:

?  序列的查找是一致的。

?  序列選取應(yīng)在基因的保守區(qū)段。

?  選取合適的擴(kuò)增片段大小。

?  避免引物自身或與引物之間形成4個(gè)或4個(gè)以上連續(xù)配對(duì)。

?  避免引物自身形成環(huán)狀發(fā)卡結(jié)構(gòu)。

? Tm值在55-65℃,GC含量在40%-60%。

?  引物之間的Tm相差避免超過2℃。

?  引物的3’端避免出現(xiàn)3個(gè)或3個(gè)以上連續(xù)相同的堿基。

不同處:

熒光定量PCR 引物

?  PCR產(chǎn)物長度:要求在300bp以內(nèi),一般80-150bp之間。

?  引物特異性:對(duì)引物要求高,盡量減少引物二聚體的產(chǎn)生,熔解曲線要求單一產(chǎn)物。

?  擴(kuò)增效率:熒光定量 PCR的目的是進(jìn)行定量或者相對(duì)定量,擴(kuò)增效率應(yīng)在90%—110%之間。

?  多對(duì)目的基因同時(shí)擴(kuò)增,文獻(xiàn)上查來的引物條件會(huì)不同,需要設(shè)計(jì)盡可能條件一致的引物。

?  目的基因含量比較低時(shí),需要設(shè)計(jì)靈敏度比較高的引物。
 

普通PCR 引物

?  普通PCR的擴(kuò)增長度,根據(jù)實(shí)驗(yàn)的要求不同,一般是從150bp到幾千bp不等。

?  相對(duì)于熒光定量PCR,普通PCR對(duì)二級(jí)結(jié)構(gòu)要求較低。

?  對(duì)擴(kuò)增效率要求不高。

?  可以選用梯度PCR儀,選擇不同退火溫度,對(duì)引物退火溫度要求不需要一致。


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